Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

ADF

ADF (Amsterdam Density Functional) to program umożliwiający obliczenia kwantowochemiczne układów molekularnych z zastosowaniem teorii funkcjonałów gęstości (DFT). Jedną z jego unikalnych właściwości jest wykorzystywanie do obliczeń baz funkcyjnych opartych na funkcje typu Slatera (STO) zamiast powszechnie stosowanych baz zbudowanych z funkcji gaussowskich (GTO). Dodatkową zaletą pakietu są rozbudowane narzędzia graficzne umożliwiające zaawansowaną analizę wyników.


Status:   Aplikacja dostępna częściowo – nie wszystkie wersje działają poprawnie. Działające wersje 12/14. Działające klastry 3/3.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/adf

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Tak

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Dziedziny: Chemia, Chemia kwantowa

Tagi: Density Functional Theory, Modelowanie molekularne, STO, Teoria Funkcjonałów Gęstości

Licencja: Licencja własna ADF szczegóły »

Pełny opis licencji znajduje się na stronie http://www.scm.com/Sales/LicTerms.html

Producent: Scientific Computing & Modelling (SCM) NV

Adres strony: http://www.scm.com/Products/ADF.html

Opiekun: Tak


← Inne wersje

2012.01c

Status:   Aplikacja dostępna produkcyjnie i działająca poprawnie. Działające instancje 1/1.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/adf/2012.01c

Stan wersji: Dostępna

Testowana: Tak

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014


Aby zobaczyć listę ośrodków, w których dostępne są konkretne wersje aplikacji, musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

ADF

Skrypty oblczeniowe

SLURM

#!/bin/env bash
##### Amount of nodes requested by job
#SBATCH --nodes=1
##### Amount of tasks per node
#SBATCH --tasks-per-node=24
##### Wall time requested by job
#SBATCH --time=15:00
##### Max amount of RAM requested by job per cpu
#SBATCH --mem-per-cpu=4gb
##### Partition name
#SBATCH -p plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#SBATCH --job-name=adf.parallel
##### Name of computational grant used
#SBATCH -A <computational grant name>

echo "Computation started on work node: "; hostname

# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf
 
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
 
# Commands to start computations
adf < input.in  >& input.log
 
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR

PBS

#!/bin/env bash
##### Max amount of RAM requested by job 
#PBS -l mem=12gb
##### Amount of nodes=x:cores=y requested by job
#PBS -l nodes=1:ppn=12
##### Wall time requested by job
#PBS -l walltime=15:00
##### Queue name
#PBS -q plgrid-testing
##### Name of job in queuing system
#PBS -N adf.parallel
##### Name of computational grant used
#PBS -A <computational grant name>

echo "Computation started on work node: "; hostname

# Set environment for default ADF version
module add plgrid/apps/adf

# Changing directory to one from which PBS script was stated (where inputs should be stored)
cd $PBS_O_WORKDIR
 
# Information about temporary scratch directory
echo "Temporary files stored in" $SCM_TMPDIR
 
# Commands to start computations
adf < input.in  >& input.log
 
# Remove the scratch dir
rm -f $SCM_TMPDIR
Nie podano dokumentacji dla tej wersji aplikacji.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości

Brak wiadomości do wyświetlenia!