Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

allpathslg

short read genome assembler


Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/allpathslg

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 22 sierpnia 2015

Dziedziny: DNA de novo assembly

Producent: Broad Institute

Adres strony: http://www.broadinstitute.org/software/allpaths-lg/blog/

Opiekun: Tak


← Inne wersje

52488

Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/allpathslg/52488

Stan wersji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 22 sierpnia 2015


Aby zobaczyć listę ośrodków, w których dostępne są konkretne wersje aplikacji, musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

The package provides the user with de novo assembly software for the whole-genome data sets. The software described here (ALLPATH-LG) replaces the old assembler ALLPATHS. The latest version works on both small and large (mammalian size) genomes. To use it, you should first generate ~100 base Illumina reads from two libraries: one from ~180 bp fragments, and one from ~3000 bp fragments, both at about 45x coverage.

Nie podano dokumentacji dla tej wersji aplikacji.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości

Brak wiadomości do wyświetlenia!