Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

ncbi-rmblastn

RMBlast is a RepeatMasker compatible version of the standard NCBI BLAST suite.


Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/ncbi-rmblastn

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Dziedziny: Sekwencjonowanie DNA

Adres strony: http://www.repeatmasker.org/RMBlast.html

Opiekun: Tak


← Inne wersje

2.2.28

Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/ncbi-rmblastn/2.2.28

Stan wersji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014


Aby zobaczyć listę ośrodków, w których dostępne są konkretne wersje aplikacji, musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

RMBlast is a RepeatMasker compatible version of the standard NCBI BLAST suite. The primary difference between this distribution and the NCBI distribution is the addition of a new program "rmblastn" for use with RepeatMasker and RepeatModeler. RMBlast supports RepeatMasker searches by adding a few necessary features to the stock NCBI blastn program. These include: Support for custom matrices ( without KA-Statistics ). Support for cross_match-like complexity adjusted scoring. Cross_match is Phil Green's seeded smith-waterman search algorithm. Support for cross_match-like masklevel filtering.

Nie podano dokumentacji dla tej wersji aplikacji.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości

Brak wiadomości do wyświetlenia!