Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

platanus

Platanus jest całkowicie od nowa opracowanym asemblerem genomowym dla danych dużej przepustowości sekwencji (illumina), zaprojektowany do asemblacji klas genomu rzędu GB (w rozmiarze danych). Charakterystyczną cechą aplikacji jest zdolność zarządzania wysoko-heterozygotycznymi próbkami. Platanus składa fragmenty DNA w ciągłe sekwencje (contigs) konstruując grafy de Bruijna wraz z wielokrotnymi rozmiarami k-mer.


Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/platanus

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Dziedziny: Bioinformatyka, Biologia Molekularna, Genetyka, Sekwencjonowanie DNA

Producent: Tokyo Institute of Technology

Adres strony: http://platanus.bio.titech.ac.jp/platanus-assembler/

Opiekun: Tak


← Inne wersje

1.2.4

Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/platanus/1.2.4

Stan wersji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 29 września 2017


Aby zobaczyć listę ośrodków, w których dostępne są konkretne wersje aplikacji, musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Nie podano dokumentacji dla tej aplikacji.
Nie podano dokumentacji dla tej wersji aplikacji.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości

Brak wiadomości do wyświetlenia!