Informacja o cookies

Zgadzam się Nasza strona zapisuje niewielkie pliki tekstowe, nazywane ciasteczkami (ang. cookies) na Twoim urządzeniu w celu lepszego dostosowania treści oraz dla celów statystycznych. Możesz wyłączyć możliwość ich zapisu, zmieniając ustawienia Twojej przeglądarki. Korzystanie z naszej strony bez zmiany ustawień oznacza zgodę na przechowywanie cookies w Twoim urządzeniu.

repeatmasker

RepeatMasker is a program that screens DNA sequences for interspersed repeats and low complexity DNA sequences


Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/repeatmasker

Stan aplikacji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014

Dziedziny: Sekwencjonowanie DNA

Adres strony: http://www.repeatmasker.org/

Opiekun: Tak


← Inne wersje

4.0.5

Status:   Aplikacja dostępna w ofercie, bez kontroli poprawności działania – nietestowana.  Aplikacja ma przydzielonego opiekuna.

Nazwa modułu: plgrid/apps/repeatmasker/4.0.5

Stan wersji: Dostępna

Testowana: Nie

Data wprowadzenia do oferty: 1 grudnia 2014


Aby zobaczyć listę ośrodków, w których dostępne są konkretne wersje aplikacji, musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

RepeatMasker is a program that screens DNA sequences for interspersed repeats and low complexity DNA sequences. The output of the program is a detailed annotation of the repeats that are present in the query sequence as well as a modified version of the query sequence in which all the annotated repeats have been masked (default: replaced by Ns). Currently over 56% of human genomic sequence is identified and masked by the program. Sequence comparisons in RepeatMasker are performed by one of several popular search engines including nhmmer, cross_match, ABBlast/WUBlast, RMBlast and Decypher. RepeatMasker makes use of curated libraries of repeats and currently supports Dfam ( profile HMM library derived from Repbase sequences ) and Repbase, a service of the Genetic Information Research Institute.

Nie podano dokumentacji dla tej wersji aplikacji.

Status monitoringu

Aby zobaczyć wyniki monitorowania aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Moduły domyślne w ścieżkach

Aby zobaczyć listę domyślnych modułów aplikacji w poszczególnych ośrodkach musisz się zalogować.
Jeśli nie masz jeszcze konta, odwiedź stronę https://portal.plgrid.pl.

Zaloguj się

Przypadki użycia

Brak przypadków użycia

Ostatnie wiadomości

Brak wiadomości do wyświetlenia!